HealthOmics Laufgruppen erstellen - AWS HealthOmics

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HealthOmics Laufgruppen erstellen

Sie können optional eine Ausführungsgruppe erstellen, um die Rechenressourcen für die Läufe, die Sie der Gruppe hinzufügen, zu begrenzen. Run-Groups können Ihnen dabei helfen:

  • Stellen Sie Ihre Läufe in eine Warteschlange, damit Sie die Dienstlimits nicht überschreiten.

  • Halten Sie ungenutzte Aufgaben fest, indem Sie eine maximale Ausführungsdauer festlegen.

  • Verwalte die Priorität jedes Laufs so, dass die wichtigsten Läufe zuerst abgeschlossen werden.

Wenn Sie die maximale Anzahl gleichzeitiger vCPU, GPU oder Läufe festlegen, werden ausgeführte Aufgaben in eine Warteschlange gestellt, wenn die maximale Anzahl erreicht ist. Wenn Sie eine maximale Ausführungsdauer festlegen, schlägt die Ausführung fehl, wenn sie die maximale Dauer überschreitet.

Verwenden Sie die Einstellung für die Ausführungspriorität, um die Priorität innerhalb einer Ausführungsgruppe festzulegen.

Dienstlimits haben Vorrang vor Grenzwerten für Ausführungsgruppen. Wenn Sie beispielsweise ein Maximum für Ausführungsgruppen auf einen höheren Wert als Ihr Dienstmaximum in einer Region festlegen, wird das Dienstmaximum HealthOmics angewendet.

Priorität ausführen

Sie können die Ausführungspriorität verwenden, um die Priorität von Läufen in einer Ausführungsgruppe festzulegen.

Wenn mehrere Läufe dieselbe Priorität haben, hat der Lauf, der zuerst gestartet wurde, die höhere Priorität.

Sie können auch eine Priorität für einen Lauf festlegen, der sich nicht in einer Ausführungsgruppe befindet. Die Priorität wird mit den Prioritäten aller anderen Läufe verglichen, die sich nicht in einer Ausführungsgruppe befinden

Sie legen die Ausführungspriorität fest, wenn Sie den Lauf starten. Weitere Informationen finden Sie unter Einen Lauf starten in HealthOmics.

Eine Run-Gruppe mithilfe der Konsole erstellen

Um eine Run-Gruppe zu erstellen
  1. Öffnen Sie die HealthOmics -Konsole.

  2. Wählen Sie im linken Navigationsbereich die Option Gruppen ausführen aus.

  3. Wählen Sie auf der Seite „Gruppen ausführen“ die Option Ausführungsgruppe erstellen aus.

  4. Geben Sie auf der Detailseite zur Ausführungsgruppe erstellen die folgenden Informationen ein

    • Name der Ausführungsgruppe — Ein eindeutiger Name für diese Ausführungsgruppe.

    • Max. vCPU für gleichzeitige Läufe — Die maximale Anzahl von vCPUs , die gleichzeitig über alle aktiven Läufe in der Ausführungsgruppe ausgeführt werden können.

    • Max GPUs — Die maximale Anzahl davon GPUs , die gleichzeitig auf allen aktiven Läufen in der Ausführungsgruppe ausgeführt werden können.

    • Max. Laufzeit (Minuten) pro Lauf — Die maximale Laufzeit für jeden Lauf (in Minuten). Wenn ein Lauf die maximale Laufzeit überschreitet, schlägt der Lauf automatisch fehl.

    • Max. Anzahl gleichzeitiger Läufe — Die maximale Anzahl von Läufen, die gleichzeitig ausgeführt werden können.

  5. (optional) Sie können der Ausführungsgruppe bis zu 50 Tags hinzufügen.

  6. Wählen Sie „Ausführungsgruppe erstellen“.

Eine Run-Gruppe mit der CLI erstellen

Um eine Ausführungsgruppe zu erstellen, verwenden Sie den create-run-groupAPI-Vorgang, um eine Ausführungsgruppe mit dem Namen zu erstellenTestRunGroup. Im folgenden Beispiel werden maximal 20 CPUs, 10 GPUs, 5 Läufe und eine maximale Ausführungsdauer von 600 Minuten festgelegt.

aws omics create-run-group --name TestRunGroup \ --max-cpus 20 \ --max-gpus 10 \ --max-duration 600 \ --max-runs 5

Die Antwort aus diesem API-Vorgang enthält die ID der neu erstelltenRunGroup.

{ "arn": "arn:aws:omics:us-west-2:12345678901:runGroup/2839621", "id": "2839621", "tags": {} }

Um zusätzliche Informationen über die Run-Gruppe zu erhalten, verwenden Sie diese ID zusammen mit dem get-run-groupAPI-Vorgang, wie im folgenden Beispiel gezeigt.

aws omics get-run-group --id run group id

Die Antwort umfasst die Grenzwerteinstellungen für die Ausführungsgruppe und die zugewiesenen Tags.

{ "arn": "arn:aws:omics:us-west-2:776893852117:runGroup/2839621", "id": "2839621", "name": "TestRunGroup", "maxCpus": 20, "maxRuns": 5, "maxDuration": 600, "creationTime": "2024-06-12T15:35:39.191730+00:00", "tags": {}, "maxGpus": 10 }

Sie können den list-run-groupAPI-Vorgang auch verwenden, um alle erstellten Ausführungsgruppen anzuzeigen.

aws omics list-run-groups