Umgebungsvariablen für HealthOmics Workflows

HealthOmics stellt Umgebungsvariablen bereit, die Informationen über den im Container ausgeführten Workflow enthalten. Sie können die Werte dieser Variablen in der Logik Ihrer Workflow-Aufgaben verwenden.

Alle HealthOmics Workflow-Variablen außer AWS_REGION und AWS_HEALTHOMICS_RESOURCE_TYPE beginne mit dem AWS_WORKFLOW_ Präfix. Dieses Präfix ist ein geschütztes Umgebungsvariablenpräfix. Verwenden Sie dieses Präfix nicht für Ihre eigenen Variablen in Workflow-Containern.

HealthOmics stellt die folgenden Workflow-Umgebungsvariablen bereit:

AWS_HEALTHOMICS_RESOURCE_TYPE

Diese Variable ist der Beschleunigertyp des aktiven Ressourcenprofils, oder cpu für ein CPU-only Profil. HealthOmics legt diese Variable für Aufgaben fest, die das verwenden omicsResourceFallbackOrder Direktive. Weitere Informationen finden Sie unter Umgebungsvariablen in Erweiterte Ressourcenkonfiguration.

AWS_REGION

Diese Variable ist die Region, in der der Container läuft.

AWS_WORKFLOW_RUN

Diese Variable ist der Name des aktuellen Laufs.

AWS_WORKFLOW_RUN_ID

Diese Variable ist die Lauf-ID des aktuellen Laufs.

AWS_WORKFLOW_RUN_UUID

Diese Variable ist die Run-UUID des aktuellen Laufs.

AWS_WORKFLOW_TASK

Diese Variable ist der Name der aktuellen Aufgabe.

AWS_WORKFLOW_TASK_ID

Diese Variable ist die Aufgabenkennung der aktuellen Aufgabe.

AWS_WORKFLOW_TASK_UUID

Diese Variable ist die Aufgaben-UUID der aktuellen Aufgabe.

Das folgende Beispiel zeigt typische Werte für jede Umgebungsvariable:

AWS Region: us-east-1
Workflow Run: arn:aws:omics:us-east-1:123456789012:run/6470304
Workflow Run ID: 6470304
Workflow Run UUID: a1b2c3d4-5678-90ab-cdef-EXAMPLE22222
Workflow Task: arn:aws:omics:us-east-1:123456789012:task/4192063
Workflow Task ID: 4192063
Workflow Task UUID: a1b2c3d4-5678-90ab-cdef-EXAMPLE33333