Uso de bibliotecas de Python con EMR Serverless - Amazon EMR

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Uso de bibliotecas de Python con EMR Serverless

Cuando ejecuta PySpark trabajos en aplicaciones Amazon EMR Serverless, puede empaquetar varias bibliotecas de Python como dependencias. Para ello, puede utilizar las funciones nativas de Python, crear un entorno virtual o configurar directamente sus PySpark trabajos para utilizar las bibliotecas de Python. En esta página se describe cada enfoque.

Uso de funciones nativas de Python

Si estableces la siguiente configuración, puedes utilizarla PySpark para cargar archivos de Python (.py), paquetes de Python comprimidos (.zip) y archivos Egg (.egg) a los ejecutores de Spark.

--conf spark.submit.pyFiles=s3://amzn-s3-demo-bucket/EXAMPLE-PREFIX/<.py|.egg|.zip file>

Para obtener más información sobre cómo utilizar los entornos virtuales de Python para los PySpark trabajos, consulte Uso de funciones PySpark nativas.

Creación de un entorno virtual de Python

Para empaquetar varias bibliotecas de Python para un PySpark trabajo, puede crear entornos virtuales de Python aislados.

  1. Para crear el entorno virtual de Python, utilice los siguientes comandos. El ejemplo que se muestra instala los paquetes scipy matplotlib en un paquete de entorno virtual y copia el archivo en una ubicación de Amazon S3.

    importante

    Debe ejecutar los siguientes comandos en un entorno de Amazon Linux 2 similar con la misma versión de Python que utiliza en EMR Serverless, es decir, Python 3.7.10 para Amazon EMR versión 6.6.0. Puede encontrar un ejemplo de Dockerfile en el repositorio Serverless Samples. EMR GitHub

    # initialize a python virtual environment python3 -m venv pyspark_venvsource source pyspark_venvsource/bin/activate # optionally, ensure pip is up-to-date pip3 install --upgrade pip # install the python packages pip3 install scipy pip3 install matplotlib # package the virtual environment into an archive pip3 install venv-pack venv-pack -f -o pyspark_venv.tar.gz # copy the archive to an S3 location aws s3 cp pyspark_venv.tar.gz s3://amzn-s3-demo-bucket/EXAMPLE-PREFIX/ # optionally, remove the virtual environment directory rm -fr pyspark_venvsource
  2. Envía el trabajo de Spark con tus propiedades configuradas para usar el entorno virtual de Python.

    --conf spark.archives=s3://amzn-s3-demo-bucket/EXAMPLE-PREFIX/pyspark_venv.tar.gz#environment --conf spark.emr-serverless.driverEnv.PYSPARK_DRIVER_PYTHON=./environment/bin/python --conf spark.emr-serverless.driverEnv.PYSPARK_PYTHON=./environment/bin/python --conf spark.executorEnv.PYSPARK_PYTHON=./environment/bin/python

    Tenga en cuenta que si no anula el binario de Python original, será --conf spark.executorEnv.PYSPARK_PYTHON=python la segunda configuración de la secuencia de ajustes anterior.

    Para obtener más información sobre cómo utilizar los entornos virtuales de Python para los PySpark trabajos, consulte Uso de Virtualenv. Para ver más ejemplos de cómo enviar trabajos de Spark, consulta. Empleos en Spark

Configuración de PySpark trabajos para usar bibliotecas de Python

Con las EMR versiones 6.12.0 y posteriores de Amazon, puede configurar directamente los PySpark trabajos EMR sin servidor para que utilicen bibliotecas Python populares de ciencia de datos, como pandas NumPy, y PyArrowsin ninguna configuración adicional.

Los siguientes ejemplos muestran cómo empaquetar cada biblioteca de Python para un PySpark trabajo.

NumPy

NumPy es una biblioteca de Python para computación científica que ofrece matrices y operaciones multidimensionales para matemáticas, clasificación, simulación aleatoria y estadísticas básicas. Para utilizarla NumPy, ejecute el siguiente comando:

import numpy
pandas

pandas es una biblioteca de Python que se basa en. NumPy La biblioteca pandas proporciona a los científicos de datos estructuras de DataFramedatos y herramientas de análisis de datos. Para usar pandas, ejecuta el siguiente comando:

import pandas
PyArrow

PyArrow es una biblioteca de Python que administra datos en columnas en memoria para mejorar el rendimiento laboral. PyArrow se basa en la especificación de desarrollo multilenguaje Apache Arrow, que es una forma estándar de representar e intercambiar datos en formato de columnas. Para usarlo PyArrow, ejecute el siguiente comando:

import pyarrow