Variables de entorno para HealthOmics flujos de trabajo

HealthOmics proporciona variables de entorno que contienen información sobre el flujo de trabajo que se ejecuta en el contenedor. Puede usar los valores de estas variables en la lógica de sus tareas de flujo de trabajo.

Todas HealthOmics variables de flujo de trabajo excepto AWS_REGION y AWS_HEALTHOMICS_RESOURCE_TYPE comience con el AWS_WORKFLOW_ prefijo. Este prefijo es un prefijo de variable de entorno protegido. No utilices este prefijo para tus propias variables en los contenedores de flujo de trabajo.

HealthOmics proporciona las siguientes variables de entorno de flujo de trabajo:

AWS_HEALTHOMICS_RESOURCE_TYPE

Esta variable es el tipo de acelerador del perfil de recursos activo, o cpu para un CPU-only perfil. HealthOmics establece esta variable para las tareas que utilizan el omicsResourceFallbackOrder directiva. Para obtener más información, consulta Variables de entorno en Configuración avanzada de recursos.

AWS_REGION

Esta variable es la región en la que se ejecuta el contenedor.

AWS_WORKFLOW_RUN

Esta variable es el nombre de la ejecución actual.

AWS_WORKFLOW_RUN_ID

Esta variable es el identificador de ejecución de la ejecución actual.

AWS_WORKFLOW_RUN_UUID

Esta variable es el UUID de ejecución de la ejecución actual.

AWS_WORKFLOW_TASK

Esta variable es el nombre de la tarea actual.

AWS_WORKFLOW_TASK_ID

Esta variable es el identificador de la tarea actual.

AWS_WORKFLOW_TASK_UUID

Esta variable es el UUID de la tarea actual.

El siguiente ejemplo muestra los valores típicos de cada variable de entorno:

AWS Region: us-east-1
Workflow Run: arn:aws:omics:us-east-1:123456789012:run/6470304
Workflow Run ID: 6470304
Workflow Run UUID: a1b2c3d4-5678-90ab-cdef-EXAMPLE22222
Workflow Task: arn:aws:omics:us-east-1:123456789012:task/4192063
Workflow Task ID: 4192063
Workflow Task UUID: a1b2c3d4-5678-90ab-cdef-EXAMPLE33333