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Notas de lanzamiento de la versión de Nextflow para HealthOmics - AWS HealthOmics

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Notas de lanzamiento de la versión de Nextflow para HealthOmics

Esta página contiene las notas de lanzamiento de cada versión de Nextflow compatible en. HealthOmics Cada sección resume las nuevas funciones, mejoras y obsolescencias para una versión específica de Nextflow.

Notas de la versión 26.04 de Nextflow

En las tablas siguientes se resume la HealthOmics compatibilidad con las nuevas funciones, mejoras y obsolescencias publicadas en la versión 26.04 de Nextflow.

Nuevas características y mejoras

Característica Desde la versión HealthOmics soporte Notas
Analizador sintáctico estricto (predeterminado) 26.04 Sí Habilitado de forma predeterminada a partir de la versión 26.04. El analizador antiguo está disponible syntaxVersion: "v1" en la configuración del motor.
Tipos de registro 26.04 Sí Para obtener más información, consulte Registros en la documentación de Seqera Nextflow.
Resúmenes de los resultados del flujo de trabajo 26.04 Sí Imprime un resumen de los resultados del flujo de trabajo al finalizar la ejecución. El formato de salida se puede configurar mediante outputFormat los ajustes del motor. Para obtener más información, consulte Especifique la configuración del motor Nextflow.
Modo de registro de agentes 26.04 Sí Configurable mediante los ajustes agentMode del motor. Para obtener más información, consulte Especifique la configuración del motor Nextflow.
Sistema de módulos (Nextflow Registry) 26.04 No HealthOmics los flujos de trabajo se ejecutan en una red aislada sin acceso saliente a Internet. Puedes incluir los módulos directamente en el zip de tu flujo de trabajo.
Escritura estática (vista previa) 26.04 No HealthOmics no admite funciones de vista previa.
Auto-load parámetros de recopilación de archivos 26.04 No Requiere escritura estática (vista previa), lo cual HealthOmics no es compatible.
Multi-revision pago de oleoductos 26.04 N/A No se aplica. HealthOmics no utiliza Git-based Pipeline Checkout.

Obsolescencias

Artículo obsoleto Desde la versión Impact Acción recomendada
Método de listFiles() 26.04 Advertencia de obsolescencia Sustituir por. listDirectory()
Indicador nextflow.enable.strict 26.04 Ya no es necesario Eliminar de la configuración. El modo estricto es ahora el predeterminado.
manifest.defaultBranch 26.04 Ya no es necesario Eliminar de la configuración. HealthOmics no usa Git-based Pipeline Checkout y nunca ha admitido esta opción.