Variables d'environnement pour HealthOmics flux de travail

HealthOmics fournit des variables d'environnement contenant des informations sur le flux de travail exécuté dans le conteneur. Vous pouvez utiliser les valeurs de ces variables dans la logique de vos tâches de flux de travail.

Tous HealthOmics variables de flux de travail sauf AWS_REGION et AWS_HEALTHOMICS_RESOURCE_TYPE commencez par AWS_WORKFLOW_ préfixe. Ce préfixe est un préfixe de variable d'environnement protégée. N'utilisez pas ce préfixe pour vos propres variables dans les conteneurs de flux de travail.

HealthOmics fournit les variables d'environnement de flux de travail suivantes :

AWS_HEALTHOMICS_RESOURCE_TYPE

Cette variable est le type d'accélérateur du profil de ressource actif, ou cpu pour un CPU-only profil. HealthOmics définit cette variable pour les tâches qui utilisent omicsResourceFallbackOrder directive. Pour plus d’informations, consultez Variables d’environnement dans Configuration avancée des ressources.

AWS_REGION

Cette variable correspond à la région dans laquelle le conteneur s'exécute.

AWS_WORKFLOW_RUN

Cette variable est le nom de l'exécution en cours.

AWS_WORKFLOW_RUN_ID

Cette variable est l'identifiant de l'exécution en cours.

AWS_WORKFLOW_RUN_UUID

Cette variable est l'UUID d'exécution de l'exécution en cours.

AWS_WORKFLOW_TASK

Cette variable est le nom de la tâche en cours.

AWS_WORKFLOW_TASK_ID

Cette variable est l'identifiant de la tâche en cours.

AWS_WORKFLOW_TASK_UUID

Cette variable est l'UUID de la tâche en cours.

L'exemple suivant montre les valeurs types pour chaque variable d'environnement :

AWS Region: us-east-1
Workflow Run: arn:aws:omics:us-east-1:123456789012:run/6470304
Workflow Run ID: 6470304
Workflow Run UUID: a1b2c3d4-5678-90ab-cdef-EXAMPLE22222
Workflow Task: arn:aws:omics:us-east-1:123456789012:task/4192063
Workflow Task ID: 4192063
Workflow Task UUID: a1b2c3d4-5678-90ab-cdef-EXAMPLE33333