HealthOmics quotas de taille fixe - AWS HealthOmics

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HealthOmics quotas de taille fixe

En plus de celaHealthOmics quotas de service, HealthOmics inclut des quotas dont la taille est fixe. Vous ne pouvez pas demander d'augmentation pour ces valeurs.

Sauf indication contraire, chaque quota indique la valeur maximale par région.

HealthOmics quotas de taille fixe pour les analyses

Le tableau suivant indique les valeurs maximales prises en charge pour les quotas d'analyse. Ces valeurs ne sont pas ajustables.

Name (Nom) Description Maximum Réglable Oui/Non
Analytics - Nombre maximum de fichiers par tâche d'importation du magasin d'annotations Nombre maximal de fichiers par tâche d'importation d'annotations. 1 Non

HealthOmics quotas de stockage de taille fixe

Le tableau suivant indique les valeurs maximales prises en charge pour les fichiers de stockage. Ces valeurs ne sont pas ajustables.

Name (Nom) Description Maximum Réglable Oui/Non
Stockage : taille maximale de la politique de ressources d'accès S3 La taille maximale de la politique de ressources d'accès S3 15 KO Non
Stockage : nombre maximal de balises de niveau défini propagées Le nombre maximum de clés de balise de niveau défini, par magasin, qui se propagent à l'objet S3 5 Non
Stockage : nombre maximum de jeux de lecture par tâche d'activation Le nombre maximum d'ensembles de lecture par tâche d'activation. 20 Non
Stockage : nombre maximum de jeux de lecture par tâche d'exportation Le nombre maximum de jeux de lecture par tâche d'exportation. 100 Non
Stockage : nombre maximum de jeux de lecture par tâche d'importation Le nombre maximum d'ensembles de lecture par tâche d'importation. 100 Non
Stockage - Nombre maximum de magasins de référence Le nombre maximum de magasins de référence. 1 Non
Stockage : taille maximale des pièces pour un téléchargement direct Taille de pièce maximale pour le téléchargement direct vers un magasin de séquences. 100 Mo Non
Stockage - Nombre maximum de pièces dans le fichier pour le téléchargement direct Nombre maximal de parties d'un fichier pouvant être téléchargées directement vers un magasin de séquences. 10 000 Non
Stockage - Taille de référence maximale Taille maximale d'un fichier de référence pouvant être importé dans un magasin de référence. 15 Go Non
Stockage : taille maximale de la source du set de lecture Taille maximale d'un seul fichier source dans un ensemble de lectures pouvant être importé dans un magasin de séquences. 976 GO Non

HealthOmics quotas de taille fixe du flux de travail

Le tableau suivant indique les valeurs maximales prises en charge pour les quotas de flux de travail. Ces valeurs ne sont pas ajustables.

Name (Nom) Description Taille maximum Réglable Oui/Non
Workflows - Nombre maximum de groupes d'exécution Le nombre maximum de groupes d'essais. 1 000 Non
Workflows - Nombre maximal de caches d'exécution Nombre maximal de caches d'exécution que vous pouvez créer pour un compte.

Une ou plusieurs exécutions peuvent partager le même cache d'exécution. Il n'y a pas de quota pour le nombre d'exécutions HealthOmics pouvant être mises en cache par compte.

1 000 Non
Workflows - Nombre maximum de versions de workflows Le nombre maximum de versions de flux de travail par flux de travail. 1 000 Non
Workflows : taille du conteneur de l'instance du processeur Taille d'image de conteneur maximale pour une instance de processeur. 45 GiB Non
Workflows : taille du conteneur de l'instance GPU Taille d'image de conteneur maximale pour une instance de GPU. 95 GiB Non
Mémoire partagée de l'instance GPU /dev/shm La quantité maximale de mémoire partagée par instance de GPU. 8 Go par GPU Non
Workflows - Exécuter le fichier de paramètres Taille maximale d'un fichier de paramètres d'exécution. 50 000 octets Non
Workflows - Fichier modèle de paramètres de flux de travail Nombre maximum d'entrées et taille de fichier maximale pour un fichier modèle de paramètres de flux de travail. Ce quota s'applique aux flux de travail que vous créez à l'aide de la console ou de l'API. 1 000 entrées, 400 Ko Non
Flux de travail - Taille du fichier de définition du flux de travail - API Taille maximale du fichier de définition du flux de travail lorsque vous créez le flux de travail à l'aide de l'opération API ou d'un AWS SDK. 100 Mo Non
Flux de travail - Taille du fichier de définition du flux de travail - Console (téléchargement direct) Taille maximale du fichier de définition du flux de travail que vous pouvez fournir sous forme de téléchargement direct, lorsque vous créez le flux de travail à l'aide de la console. 4,4 MO Non
Flux de travail - Taille du fichier de définition du flux de travail - Console (téléchargement depuis Amazon S3) Taille maximale du fichier de définition du flux de travail que vous pouvez fournir sous forme de téléchargement depuis Amazon S3, lorsque vous créez le flux de travail à l'aide de la console. 100 Mo Non
Workflows - Taille du référentiel Taille maximale d'un référentiel de code externe. 1 Gio Non
Workflows - Taille de fichier individuelle du référentiel Taille maximale d'un fichier individuel provenant d'un référentiel de code externe. 100 Mio Non
Workflows - Taille du fichier README Taille maximale d'un fichier README. 500 KIB Non

Pour obtenir des suggestions sur la manière de réduire la taille de votre fichier de paramètres d'exécution, consultezGestion de la taille des paramètres d'exécution.

HealthOmics Quotas de taille fixe pour le workflow Ready2Run

Chaque flux de travail Ready2Run possède une taille de fichier d'entrée maximale. Dans le tableau suivant, les unités de taille de fichier sont répertoriées en Gibioctets (GiB). Ces tailles de fichier maximales ne sont pas ajustables.

Nom du flux de travail Ready2Run Taille maximale du fichier d'entrée (GiB) Réglable (Oui/Non)
AlphaFold pour 601 à 1200 résidus 1 Non
AlphaFold pour un maximum de 600 résidus 1 Non
Bases2Fastq pour 2x150 1 000 Non
Bases2Fastq pour 2x300 1 000 Non
Bases2Fastq pour 2x75 500 Non
ESMFold pour jusqu'à 800 résidus 1 Non
GATK-BP fq2bam 64 Non
GATK-BP Germline bam2vcf pour un génome 30x 39 Non
Lignée germinale GATK-BP fq2vcf pour le génome 30x 64 Non
GATK-BP Somatic WES bam2vcf 86 Non
NVIDIA Parabricks BAM2 FQ2 BAM WGS jusqu'à 30 fois 80 Non
NVIDIA Parabricks BAM2 FQ2 BAM WGS jusqu'à 50 fois 120 Non
NVIDIA Parabricks BAM2 FQ2 BAM WGS pour un maximum de 5 fois 20 Non
NVIDIA Parabricks FQ2 BAM WGS jusqu'à 30 fois 71 Non
NVIDIA Parabricks FQ2 BAM WGS jusqu'à 50 fois 137 Non
NVIDIA Parabricks FQ2 BAM WGS pour un maximum de 5 fois 13 Non
NVIDIA Parabricks Germline DeepVariant WGS jusqu'à 30 fois 71 Non
NVIDIA Parabricks Germline DeepVariant WGS jusqu'à 50 fois 137 Non
NVIDIA Parabricks Germline DeepVariant WGS pour un maximum de 5 fois 12 Non
NVIDIA Parabricks Germline HaplotypeCaller WGS jusqu'à 30 fois 71 Non
NVIDIA Parabricks Germline HaplotypeCaller WGS jusqu'à 50 fois 137 Non
NVIDIA Parabricks Germline HaplotypeCaller WGS pour un maximum de 5 fois 13 Non
NVIDIA Parabricks Somatic Mutect2 WGS jusqu'à 50 fois 196 Non
sc RNAseq avec Kallisto BUStools 119 Non
sc RNAseq avec saumon sauté aux alevins 119 Non
sc RNAseq avec STARsolo 119 Non
Sentieon Germline BAM WES jusqu'à 300 fois 9 Non
Sentieon Germline BAM WGS jusqu'à 32 fois 18 Non
Sentieon Germline FASTQ WES jusqu'à 100 fois 5 Non
Sentieon Germline FASTQ WES jusqu'à 300 fois 26 Non
Sentieon Germline FASTQ WGS jusqu'à 32 fois 51 Non
Sentieon LongRead pour ONT 25 Non
Sentieon LongRead pour PacBio HiFi 58 Non
Sentieon Somatic WES 50 Non
Sentieon Somatic WGS 113 Non
Ultima Genomics jusqu' DeepVariant à 40 fois 91 Non