Creazione di nuove versioni degli archivi di HealthOmics annotazioni

È possibile creare nuove versioni degli archivi di annotazioni per raccogliere diverse versioni dei database di annotazioni. In questo modo è possibile organizzare i dati delle annotazioni, che vengono aggiornati regolarmente.

Per creare una nuova versione di un archivio di annotazioni esistente, utilizza l'create-annotation-store-versionAPI come mostrato nell'esempio seguente.

aws omics create-annotation-store-version \
     --name my_annotation_store \
     --version-name my_version  

Riceverai la seguente risposta con l'ID della versione dell'Annotation Store, che conferma che è stata creata una nuova versione dell'annotazione.

{
     "creationTime": "2023-07-21T17:15:49.251040+00:00",
     "id": "3b93cdef69d2",
     "name": "my_annotation_store",
     "reference": {
         "referenceArn": "arn:aws:omics:us-west-2:555555555555:referenceStore/6505293348/reference/5987565360"
     },
     "status": "CREATING",
     "versionName": "my_version"
}             

Per aggiornare la descrizione di una versione dell'archivio di annotazioni, puoi utilizzare update-annotation-store-versionper aggiungere aggiornamenti a una versione dell'archivio di annotazioni.

aws omics update-annotation-store-version \
    --name my_annotation_store \
    --version-name my_version \
    --description "New Description"    

Riceverai la seguente risposta, che conferma che la versione dell'annotation store è stata aggiornata.

{
     "storeId": "4934045d1c6d",
     "id": "2a3f4a44aa7b",
     "description":"New Description",
     "status": "ACTIVE",
     "name": "my_annotation_store",
     "versionName": "my_version",
     "creation Time": "2023-07-21T17:20:59.380043+00:00",
     "updateTime": "2023-07-21T17:26:17.892034+00:00"
}              

Per visualizzare i dettagli di una versione dell'Annotation Store, usa. get-annotation-store-version

aws omics get-annotation-store-version --name my_annotation_store --version-name my_version              

Riceverai una risposta con il nome della versione, lo stato e altri dettagli.

{
     "storeId": "4934045d1c6d",
     "id": "2a3f4a44aa7b",
     "status": "ACTIVE",
     "versionArn": "arn:aws:omics:us-west-2:555555555555:annotationStore/my_annotation_store/version/my_version",
     "name": "my_annotation_store",
     "versionName": "my_version",
     "creationTime": "2023-07-21T17:15:49.251040+00:00",
     "updateTime": "2023-07-21T17:15:56.434223+00:00",
     "statusMessage": "",
     "versionSizeBytes": 0
    }        
      

Per visualizzare tutte le versioni di un archivio di annotazioni, è possibile utilizzare list-annotation-store-versions, come illustrato nell'esempio seguente.

aws omics list-annotation-store-versions --name my_annotation_store

Riceverai una risposta con le seguenti informazioni

{
  "annotationStoreVersions": [
    {
     "storeId": "4934045d1c6d",
     "id": "2a3f4a44aa7b",
     "status": "CREATING",
     "versionArn": "arn:aws:omics:us-west-2:555555555555:annotationStore/my_annotation_store/version/my_version_2",
     "name": "my_annotation_store",
     "versionName": "my_version_2",
     "creation Time": "2023-07-21T17:20:59.380043+00:00",
     "versionSizeBytes": 0
    },
    {
     "storeId": "4934045d1c6d",
     "id": "4934045d1c6d",
     "status": "ACTIVE",
     "versionArn": "arn:aws:omics:us-west-2:555555555555:annotationStore/my_annotation_store/version/my_version_1",
     "name": "my_annotation_store",
     "versionName": "my_version_1",
     "creationTime": "2023-07-21T17:15:49.251040+00:00",
     "updateTime": "2023-07-21T17:15:56.434223+00:00",
     "statusMessage": "",
     "versionSizeBytes": 0
    }
}             

Se non è più necessaria una versione dell'archivio di annotazioni, è possibile utilizzare delete-annotation-store-versionsper eliminare una versione dell'archivio di annotazioni, come illustrato nell'esempio seguente.

aws omics delete-annotation-store-versions --name my_annotation_store --versions my_version  

Se la versione dello store viene eliminata senza errori, riceverai la seguente risposta.

{
  "errors": []
}                

In caso di errori, riceverai una risposta con i dettagli degli errori, come mostrato.

{
  "errors": [
    {
      "versionName": "my_version",
      "message": "Version with versionName: my_version was not found."
    }
  ]
}  

Se tenti di eliminare una versione di Annotation Store con un processo di importazione attivo, riceverai una risposta con un errore, come mostrato.

{
  "errors": [
    {
      "versionName": "my_version",
      "message": "version has an inflight import running"
    }
  ]
}  

In questo caso, è possibile forzare l'eliminazione della versione dell'annotation store, come mostrato nell'esempio seguente.

aws omics delete-annotation-store-versions --name my_annotation_store --versions my_version --force