HealthOmics quote a dimensione fissa - AWS HealthOmics

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HealthOmics quote a dimensione fissa

Oltre aHealthOmics quote di servizio, HealthOmics include quote con dimensioni fisse. Non è possibile richiedere un aumento per questi valori.

Salvo diversa indicazione, ogni quota elenca il valore massimo per regione.

HealthOmics analisi: quote a dimensione fissa

La tabella seguente mostra i valori massimi supportati per le quote di analisi. Questi valori non sono regolabili.

Nome Descrizione Massimo Regolabile Sì/No
Analytics: numero massimo di file per processo di importazione dell'archivio di annotazioni Il numero massimo di file per processo di importazione delle annotazioni. 1 No

HealthOmics quote di archiviazione a dimensione fissa

La tabella seguente mostra i valori massimi supportati per i file di archiviazione. Questi valori non sono regolabili.

Nome Descrizione Massimo Regolabile Sì/No
Storage: dimensione massima della policy di accesso alle risorse di accesso S3 La dimensione massima della politica delle risorse di accesso S3 15 KB No
Archiviazione: numero massimo di tag a livello di set propagati Il numero massimo di chiavi di tag a livello di set, per archivio, che si propagano all'oggetto S3 5 No
Archiviazione: numero massimo di set di lettura per processo di attivazione Il numero massimo di set di lettura per processo di attivazione. 20 No
Archiviazione: numero massimo di set di lettura per processo di esportazione Il numero massimo di set di lettura per processo di esportazione. 100 No
Archiviazione: numero massimo di set di lettura per processo di importazione Il numero massimo di set di lettura per processo di importazione. 100 No
Archiviazione: numero massimo di archivi di riferimento Il numero massimo di negozi di riferimento. 1 No
Archiviazione: dimensione massima della parte per un caricamento diretto La dimensione massima della parte per il caricamento diretto in un archivio di sequenze. 100 MB No
Archiviazione: numero massimo di parti nel file per il caricamento diretto Il numero massimo di parti in un file per il caricamento diretto in un archivio di sequenze. 10.000 No
Archiviazione: dimensione massima di riferimento La dimensione massima di un file di riferimento che può essere importato in un archivio di riferimento. 15 GB No
Archiviazione: dimensione massima della sorgente impostata per la lettura La dimensione massima di un singolo file sorgente in un set di lettura che può essere importato in un archivio di sequenze. 976 GB No

HealthOmics quote a dimensione fissa per il flusso di lavoro

La tabella seguente mostra i valori massimi supportati per le quote del flusso di lavoro. Questi valori non sono regolabili.

Nome Descrizione Dimensione massima Regolabile Sì/No
Flussi di lavoro: numero massimo di gruppi di esecuzione Il numero massimo di gruppi di esecuzione. 1000 No
Flussi di lavoro: numero massimo di cache di esecuzione Il numero massimo di cache di esecuzione che è possibile creare per un account.

Una o più esecuzioni possono condividere la stessa cache di esecuzione. Non esiste una quota per il numero di esecuzioni che HealthOmics possono essere memorizzate nella cache per account.

1000 No
Flussi di lavoro: numero massimo di versioni del flusso di lavoro Il numero massimo di versioni del flusso di lavoro per flusso di lavoro. 1000 No
Flussi di lavoro: dimensione del contenitore dell'istanza della CPU La dimensione massima dell'immagine del contenitore per un'istanza di CPU. 45 GiB No
Flussi di lavoro: dimensione del contenitore dell'istanza GPU La dimensione massima dell'immagine del contenitore per un'istanza GPU. 95 GiB No
Memoria condivisa dell'istanza GPU /dev/shm La quantità massima di memoria condivisa per istanza GPU. 8 GB per GPU No
Flussi di lavoro: esegui il file dei parametri La dimensione massima di un file dei parametri di esecuzione. 50.000 byte No
Flussi di lavoro: file modello dei parametri del flusso di lavoro Il numero massimo di voci e la dimensione massima del file per un file modello di parametri di workflow. Questa quota si applica ai flussi di lavoro creati utilizzando la console o l'API. 1.000 voci, 400 KB No
Flussi di lavoro - Dimensione del file di definizione del flusso di lavoro - API La dimensione massima del file di definizione del flusso di lavoro quando si crea il flusso di lavoro utilizzando l'operazione API o un AWS SDK. 100 MB No
Flussi di lavoro - Dimensione del file di definizione del flusso di lavoro - Console (caricamento diretto) La dimensione massima del file di definizione del flusso di lavoro che puoi fornire come caricamento diretto, quando crei il flusso di lavoro utilizzando la console. 4,4 MB No
Flussi di lavoro - Dimensione del file di definizione del flusso di lavoro - Console (caricamento da Amazon S3) La dimensione massima del file di definizione del flusso di lavoro che puoi fornire come caricamento da Amazon S3, quando crei il flusso di lavoro utilizzando la console. 100 MB No
Flussi di lavoro: dimensioni del repository La dimensione massima di un repository di codice esterno. 1 GiB No
Flussi di lavoro: dimensione dei singoli file del repository La dimensione massima di un singolo file proveniente da un archivio di codice esterno. 100 MiB No
Flussi di lavoro: dimensione del file README La dimensione massima di un file README. 500 KiB No

Per suggerimenti su come ridurre le dimensioni del file dei parametri di esecuzione, consultaGestione delle dimensioni dei parametri di esecuzione.

HealthOmics Quote a dimensione fissa del flusso di lavoro Ready2Run

Ogni flusso di lavoro Ready2Run ha una dimensione massima del file di input. Nella tabella seguente, le unità di dimensione dei file sono elencate in Gibibyte (GiB). Queste dimensioni massime dei file non sono regolabili.

Nome del flusso di lavoro Ready2Run Dimensione massima del file di input (GiB) Regolabile (Sì/No)
AlphaFold per 601-1200 residui 1 No
AlphaFold per un massimo di 600 residui 1 No
Bases2Fastq per 2x150 1000 No
Bases2Fastq per 2x300 1000 No
Bases2Fastq per 2x75 500 No
ESMFold per un massimo di 800 residui 1 No
GATK-BP fq2bam 64 No
GATK-BP Germline bam2vcf per genoma 30x 39 No
GATK-BP Germline fq2vcf per genoma 30x 64 No
GATK-BP WES somatico bam2vcf 86 No
NVIDIA Parabricks BAM2 FQ2 BAM WGS per un massimo di 30 volte 80 No
NVIDIA Parabricks BAM WGS per un massimo di 50X BAM2 FQ2 120 No
NVIDIA Parabricks BAM WGS per un massimo di 5 volte BAM2 FQ2 20 No
NVIDIA Parabricks BAM WGS per un massimo di 30 volte FQ2 71 No
NVIDIA Parabricks BAM WGS per un massimo di 50X FQ2 137 No
NVIDIA Parabricks BAM WGS per un massimo di 5 volte FQ2 13 No
NVIDIA Parabricks Germline WGS per un massimo di 30 volte DeepVariant 71 No
NVIDIA Parabricks Germline WGS per un massimo di 50X DeepVariant 137 No
NVIDIA Parabricks Germline WGS per un massimo di 5 volte DeepVariant 12 No
NVIDIA Parabricks Germline WGS per un massimo di 30 volte HaplotypeCaller 71 No
NVIDIA Parabricks Germline WGS per un massimo di 50X HaplotypeCaller 137 No
NVIDIA Parabricks Germline WGS per un massimo di 5 volte HaplotypeCaller 13 No
NVIDIA Parabricks Somatic Mutect2 WGS per un massimo di 50 volte 196 No
sc RNAseq con Kallisto BUStools 119 No
sc RNAseq con salmone Alevin-fry 119 No
sc RNAseq con STARsolo 119 No
Sentieon Germline BAM WES per un massimo di 300 volte 9 No
Sentieon Germline BAM WGS per un massimo di 32x 18 No
Sentieon Germline FASTQ WES per un massimo di 100x 5 No
Sentieon Germline FASTQ WES per un massimo di 300 volte 26 No
Sentieon Germline FASTQ WGS per un massimo di 32x 51 No
LongRead Sentieon per PNG 25 No
Sentieon per LongRead PacBio HiFi 58 No
Sentieon Somatic WES 50 No
Sentieon Somatic SGS 113 No
Ultima DeepVariant Genomics per un massimo di 40 volte 91 No