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HealthOmics quote a dimensione fissa
Oltre aHealthOmics quote di servizio, HealthOmics include quote con dimensioni fisse. Non è possibile richiedere un aumento per questi valori.
Salvo diversa indicazione, ogni quota elenca il valore massimo per regione.
Argomenti
HealthOmics analisi: quote a dimensione fissa
La tabella seguente mostra i valori massimi supportati per le quote di analisi. Questi valori non sono regolabili.
Nome | Descrizione | Massimo | Regolabile Sì/No |
---|---|---|---|
Analytics: numero massimo di file per processo di importazione dell'archivio di annotazioni | Il numero massimo di file per processo di importazione delle annotazioni. | 1 | No |
HealthOmics quote di archiviazione a dimensione fissa
La tabella seguente mostra i valori massimi supportati per i file di archiviazione. Questi valori non sono regolabili.
Nome | Descrizione | Massimo | Regolabile Sì/No |
---|---|---|---|
Storage: dimensione massima della policy di accesso alle risorse di accesso S3 | La dimensione massima della politica delle risorse di accesso S3 | 15 KB | No |
Archiviazione: numero massimo di tag a livello di set propagati | Il numero massimo di chiavi di tag a livello di set, per archivio, che si propagano all'oggetto S3 | 5 | No |
Archiviazione: numero massimo di set di lettura per processo di attivazione | Il numero massimo di set di lettura per processo di attivazione. | 20 | No |
Archiviazione: numero massimo di set di lettura per processo di esportazione | Il numero massimo di set di lettura per processo di esportazione. | 100 | No |
Archiviazione: numero massimo di set di lettura per processo di importazione | Il numero massimo di set di lettura per processo di importazione. | 100 | No |
Archiviazione: numero massimo di archivi di riferimento | Il numero massimo di negozi di riferimento. | 1 | No |
Archiviazione: dimensione massima della parte per un caricamento diretto | La dimensione massima della parte per il caricamento diretto in un archivio di sequenze. | 100 MB | No |
Archiviazione: numero massimo di parti nel file per il caricamento diretto | Il numero massimo di parti in un file per il caricamento diretto in un archivio di sequenze. | 10.000 | No |
Archiviazione: dimensione massima di riferimento | La dimensione massima di un file di riferimento che può essere importato in un archivio di riferimento. | 15 GB | No |
Archiviazione: dimensione massima della sorgente impostata per la lettura | La dimensione massima di un singolo file sorgente in un set di lettura che può essere importato in un archivio di sequenze. | 976 GB | No |
HealthOmics quote a dimensione fissa per il flusso di lavoro
La tabella seguente mostra i valori massimi supportati per le quote del flusso di lavoro. Questi valori non sono regolabili.
Nome | Descrizione | Dimensione massima | Regolabile Sì/No |
---|---|---|---|
Flussi di lavoro: numero massimo di gruppi di esecuzione | Il numero massimo di gruppi di esecuzione. | 1000 | No |
Flussi di lavoro: numero massimo di cache di esecuzione | Il numero massimo di cache di esecuzione che è possibile creare per un account. Una o più esecuzioni possono condividere la stessa cache di esecuzione. Non esiste una quota per il numero di esecuzioni che HealthOmics possono essere memorizzate nella cache per account. |
1000 | No |
Flussi di lavoro: numero massimo di versioni del flusso di lavoro | Il numero massimo di versioni del flusso di lavoro per flusso di lavoro. | 1000 | No |
Flussi di lavoro: dimensione del contenitore dell'istanza della CPU | La dimensione massima dell'immagine del contenitore per un'istanza di CPU. | 45 GiB | No |
Flussi di lavoro: dimensione del contenitore dell'istanza GPU | La dimensione massima dell'immagine del contenitore per un'istanza GPU. | 95 GiB | No |
Memoria condivisa dell'istanza GPU /dev/shm | La quantità massima di memoria condivisa per istanza GPU. | 8 GB per GPU | No |
Flussi di lavoro: esegui il file dei parametri | La dimensione massima di un file dei parametri di esecuzione. | 50.000 byte | No |
Flussi di lavoro: file modello dei parametri del flusso di lavoro | Il numero massimo di voci e la dimensione massima del file per un file modello di parametri di workflow. Questa quota si applica ai flussi di lavoro creati utilizzando la console o l'API. | 1.000 voci, 400 KB | No |
Flussi di lavoro - Dimensione del file di definizione del flusso di lavoro - API | La dimensione massima del file di definizione del flusso di lavoro quando si crea il flusso di lavoro utilizzando l'operazione API o un AWS SDK. | 100 MB | No |
Flussi di lavoro - Dimensione del file di definizione del flusso di lavoro - Console (caricamento diretto) | La dimensione massima del file di definizione del flusso di lavoro che puoi fornire come caricamento diretto, quando crei il flusso di lavoro utilizzando la console. | 4,4 MB | No |
Flussi di lavoro - Dimensione del file di definizione del flusso di lavoro - Console (caricamento da Amazon S3) | La dimensione massima del file di definizione del flusso di lavoro che puoi fornire come caricamento da Amazon S3, quando crei il flusso di lavoro utilizzando la console. | 100 MB | No |
Flussi di lavoro: dimensioni del repository | La dimensione massima di un repository di codice esterno. | 1 GiB | No |
Flussi di lavoro: dimensione dei singoli file del repository | La dimensione massima di un singolo file proveniente da un archivio di codice esterno. | 100 MiB | No |
Flussi di lavoro: dimensione del file README | La dimensione massima di un file README. | 500 KiB | No |
Per suggerimenti su come ridurre le dimensioni del file dei parametri di esecuzione, consultaGestione delle dimensioni dei parametri di esecuzione.
HealthOmics Quote a dimensione fissa del flusso di lavoro Ready2Run
Ogni flusso di lavoro Ready2Run ha una dimensione massima del file di input. Nella tabella seguente, le unità di dimensione dei file sono elencate in Gibibyte (GiB). Queste dimensioni massime dei file non sono regolabili.
Nome del flusso di lavoro Ready2Run | Dimensione massima del file di input (GiB) | Regolabile (Sì/No) |
---|---|---|
AlphaFold per 601-1200 residui | 1 | No |
AlphaFold per un massimo di 600 residui | 1 | No |
Bases2Fastq per 2x150 | 1000 | No |
Bases2Fastq per 2x300 | 1000 | No |
Bases2Fastq per 2x75 | 500 | No |
ESMFold per un massimo di 800 residui | 1 | No |
GATK-BP fq2bam | 64 | No |
GATK-BP Germline bam2vcf per genoma 30x | 39 | No |
GATK-BP Germline fq2vcf per genoma 30x | 64 | No |
GATK-BP WES somatico bam2vcf | 86 | No |
NVIDIA Parabricks BAM2 FQ2 BAM WGS per un massimo di 30 volte | 80 | No |
NVIDIA Parabricks BAM WGS per un massimo di 50X BAM2 FQ2 | 120 | No |
NVIDIA Parabricks BAM WGS per un massimo di 5 volte BAM2 FQ2 | 20 | No |
NVIDIA Parabricks BAM WGS per un massimo di 30 volte FQ2 | 71 | No |
NVIDIA Parabricks BAM WGS per un massimo di 50X FQ2 | 137 | No |
NVIDIA Parabricks BAM WGS per un massimo di 5 volte FQ2 | 13 | No |
NVIDIA Parabricks Germline WGS per un massimo di 30 volte DeepVariant | 71 | No |
NVIDIA Parabricks Germline WGS per un massimo di 50X DeepVariant | 137 | No |
NVIDIA Parabricks Germline WGS per un massimo di 5 volte DeepVariant | 12 | No |
NVIDIA Parabricks Germline WGS per un massimo di 30 volte HaplotypeCaller | 71 | No |
NVIDIA Parabricks Germline WGS per un massimo di 50X HaplotypeCaller | 137 | No |
NVIDIA Parabricks Germline WGS per un massimo di 5 volte HaplotypeCaller | 13 | No |
NVIDIA Parabricks Somatic Mutect2 WGS per un massimo di 50 volte | 196 | No |
sc RNAseq con Kallisto BUStools | 119 | No |
sc RNAseq con salmone Alevin-fry | 119 | No |
sc RNAseq con STARsolo | 119 | No |
Sentieon Germline BAM WES per un massimo di 300 volte | 9 | No |
Sentieon Germline BAM WGS per un massimo di 32x | 18 | No |
Sentieon Germline FASTQ WES per un massimo di 100x | 5 | No |
Sentieon Germline FASTQ WES per un massimo di 300 volte | 26 | No |
Sentieon Germline FASTQ WGS per un massimo di 32x | 51 | No |
LongRead Sentieon per PNG | 25 | No |
Sentieon per LongRead PacBio HiFi | 58 | No |
Sentieon Somatic WES | 50 | No |
Sentieon Somatic SGS | 113 | No |
Ultima DeepVariant Genomics per un massimo di 40 volte | 91 | No |