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Note di rilascio della versione Nextflow per HealthOmics
Questa pagina contiene le note di rilascio per ogni versione di Nextflow supportata su. HealthOmics Ogni sezione riassume le nuove funzionalità, i miglioramenti e le deprecazioni per una specifica versione di Nextflow.
Note sulla versione di Nextflow v26.04
Le tabelle seguenti riassumono il HealthOmics supporto per le nuove funzionalità, i miglioramenti e le deprecazioni rilasciate nella versione 26.04 di Nextflow.
Nuove funzionalità e miglioramenti
| Funzionalità | Dalla versione | HealthOmics supporto | Note |
|---|---|---|---|
| Parser di sintassi rigoroso (predefinito) | 26.04 | Sì | Abilitato per impostazione predefinita dalla v26.04. Parser legacy disponibile tramite syntaxVersion: "v1" le impostazioni del motore. |
| Tipi di record | 26.04 | Sì | Per ulteriori informazioni, consulta Records |
| Riepiloghi dei risultati del flusso di lavoro | 26.04 | Sì | Stampa un riepilogo dei risultati del flusso di lavoro al termine dell'esecuzione. Formato di output configurabile tramite le impostazioni outputFormat del motore. Per ulteriori informazioni, consulta Specifica le impostazioni del motore Nextflow. |
| Modalità di registrazione dell'agente | 26.04 | Sì | Configurabile tramite le impostazioni agentMode del motore. Per ulteriori informazioni, consulta Specifica le impostazioni del motore Nextflow. |
| Sistema modulare (Nextflow Registry) | 26.04 | No | HealthOmics i flussi di lavoro vengono eseguiti in una rete isolata senza accesso a Internet in uscita. È possibile includere i moduli direttamente nel file zip del flusso di lavoro. |
| Digitazione statica (anteprima) | 26.04 | No | HealthOmics non supporta le funzionalità di anteprima. |
| Auto-load parametri di raccolta dai file | 26.04 | No | Richiede una digitazione statica (anteprima), che HealthOmics non supporta. |
| Multi-revision pagamento delle pipeline | 26.04 | N/A | Non applicabile. HealthOmics non utilizza Git-based pipeline checkout. |
Raggiunta obsolescenza
| Articolo obsoleto | Dalla versione | Impatto | Azione consigliata |
|---|---|---|---|
Metodo listFiles() |
26.04 | Avviso di deprecazione | Sostituisci con. listDirectory() |
Flag nextflow.enable.strict |
26.04 | Non è più necessario | Rimuovi dalla configurazione. La modalità rigorosa è ora l'impostazione predefinita. |
manifest.defaultBranch |
26.04 | Non è più necessario | Rimuovi dalla configurazione. HealthOmics non utilizza Git-based pipeline checkout e non ha mai supportato questa opzione. |