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Note di rilascio della versione Nextflow per HealthOmics - AWS HealthOmics

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Note di rilascio della versione Nextflow per HealthOmics

Questa pagina contiene le note di rilascio per ogni versione di Nextflow supportata su. HealthOmics Ogni sezione riassume le nuove funzionalità, i miglioramenti e le deprecazioni per una specifica versione di Nextflow.

Note sulla versione di Nextflow v26.04

Le tabelle seguenti riassumono il HealthOmics supporto per le nuove funzionalità, i miglioramenti e le deprecazioni rilasciate nella versione 26.04 di Nextflow.

Nuove funzionalità e miglioramenti

Funzionalità Dalla versione HealthOmics supporto Note
Parser di sintassi rigoroso (predefinito) 26.04 Sì Abilitato per impostazione predefinita dalla v26.04. Parser legacy disponibile tramite syntaxVersion: "v1" le impostazioni del motore.
Tipi di record 26.04 Sì Per ulteriori informazioni, consulta Records nella documentazione di Seqera Nextflow.
Riepiloghi dei risultati del flusso di lavoro 26.04 Sì Stampa un riepilogo dei risultati del flusso di lavoro al termine dell'esecuzione. Formato di output configurabile tramite le impostazioni outputFormat del motore. Per ulteriori informazioni, consulta Specifica le impostazioni del motore Nextflow.
Modalità di registrazione dell'agente 26.04 Sì Configurabile tramite le impostazioni agentMode del motore. Per ulteriori informazioni, consulta Specifica le impostazioni del motore Nextflow.
Sistema modulare (Nextflow Registry) 26.04 No HealthOmics i flussi di lavoro vengono eseguiti in una rete isolata senza accesso a Internet in uscita. È possibile includere i moduli direttamente nel file zip del flusso di lavoro.
Digitazione statica (anteprima) 26.04 No HealthOmics non supporta le funzionalità di anteprima.
Auto-load parametri di raccolta dai file 26.04 No Richiede una digitazione statica (anteprima), che HealthOmics non supporta.
Multi-revision pagamento delle pipeline 26.04 N/A Non applicabile. HealthOmics non utilizza Git-based pipeline checkout.

Raggiunta obsolescenza

Articolo obsoleto Dalla versione Impatto Azione consigliata
Metodo listFiles() 26.04 Avviso di deprecazione Sostituisci con. listDirectory()
Flag nextflow.enable.strict 26.04 Non è più necessario Rimuovi dalla configurazione. La modalità rigorosa è ora l'impostazione predefinita.
manifest.defaultBranch 26.04 Non è più necessario Rimuovi dalla configurazione. HealthOmics non utilizza Git-based pipeline checkout e non ha mai supportato questa opzione.