Acceleratori di attività in una definizione di workflow HealthOmics - AWS HealthOmics

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Acceleratori di attività in una definizione di workflow HealthOmics

Nella definizione del flusso di lavoro, puoi facoltativamente specificare le specifiche dell'acceleratore GPU per un'attività. HealthOmics supporta i seguenti valori accelerator-spec, oltre ai tipi di istanza supportati:

Specifiche dell'acceleratore Tipi di istanze Healthomics
nvidia-tesla-t4 G4
nvidia-tesla-t4 a 10 g G4 e G5
nvidia-tesla-a10 g G5
nvidia-l4-a10g G5 e G6
nvidia-l4 G6
nvidia-l40s G6e

Se si specifica un tipo di acceleratore che supporta più tipi di istanza, HealthOmics seleziona il tipo di istanza in base alla capacità disponibile. Se entrambi i tipi di istanza sono disponibili, HealthOmics dà la preferenza all'istanza a basso costo.

Per informazioni dettagliate sui tipi di istanza, consultaIstanze di elaborazione accelerata.

Nell'esempio seguente, la definizione del flusso di lavoro specifica nvidia-l4 come acceleratore:

WDL
task my_task { runtime { ... acceleratorCount: 1 acceleratorType: "nvidia-l4" } ... }
NextFlow
process my_task { ... accelerator 1, type: "nvidia-l4" ... }
CWL
cwlVersion: v1.2 class: CommandLineTool requirements: ... cwltool:CUDARequirement: cudaDeviceCountMin: 1 cudaComputeCapability: "nvidia-l4" cudaVersionMin: "1.0"