File di definizione del flusso di lavoro in HealthOmics

Si utilizza una definizione di flusso di lavoro per specificare informazioni sul flusso di lavoro, sulle esecuzioni e sulle attività in corso. Le definizioni del flusso di lavoro vengono create in uno o più file utilizzando un linguaggio di definizione del flusso di lavoro. HealthOmics supporta le definizioni dei flussi di lavoro scritte in WDL, Nextflow o CWL. Per informazioni dettagliate su ciascuna di queste lingue, consulta Scrittura di definizioni di flussi di lavoro per i flussi HealthOmics di lavoro

Nella definizione del flusso di lavoro si specificano i seguenti tipi di informazioni:

• Language version— La lingua e la versione della definizione del flusso di lavoro.

• Compute and memory— I requisiti di calcolo e memoria per le attività del flusso di lavoro.

• Inputs— Ubicazione degli input per le attività del flusso di lavoro. Per ulteriori informazioni, consulta HealthOmics esegui ingressi.

• Outputs— Posizione in cui salvare gli output generati dalle attività.

• Task resources— Requisiti di calcolo e memoria per ogni attività.

• Accelerators— altre risorse richieste dalle attività, come gli acceleratori.

Argomenti

• HealthOmics requisiti di definizione del flusso di lavoro

• Supporto della versione per i linguaggi HealthOmics di definizione del flusso di lavoro

• Requisiti di calcolo e memoria per le attività HealthOmics

• Risultati delle attività in una definizione di HealthOmics flusso di lavoro

• Le risorse delle attività in una definizione di HealthOmics flusso di lavoro

• Acceleratori di attività in una definizione di workflow HealthOmics

• Scrittura di definizioni di flussi di lavoro per i flussi HealthOmics di lavoro