Amazon S3 버킷으로 HealthOmics 읽기 세트 내보내기

Amazon S3 버킷으로 배치 내보내기 작업으로 읽기 세트를 내보낼 수 있습니다. 이렇게 하려면 먼저 다음 IAM 정책 예제와 마찬가지로 버킷에 대한 쓰기 액세스 권한이 있는 IAM 정책을 생성합니다.

JSON

{
  "Version": "2012-10-17",
  "Statement": [
    {
      "Effect": "Allow",
      "Action": [
        "s3:PutObject",
        "s3:GetBucketLocation"
      ],
      "Resource": [
        "arn:aws:s3:::amzn-s3-demo-bucket1",
        "arn:aws:s3:::amzn-s3-demo-bucket1/*"
      ]
    }
  ]
}                    

JSON

{
"Version": "2012-10-17",
"Statement": [
  {
      "Effect": "Allow",
      "Principal": {
          "Service": [
              "omics.amazonaws.com"
          ]
      },
      "Action": "sts:AssumeRole"
  }
]
}                  

IAM 정책이 적용되면 읽기 세트 내보내기 작업을 시작합니다. 다음 예제에서는 start-read-set-export-job API 작업을 사용하여이 작업을 수행하는 방법을 보여줍니다. 다음 예제에서는 , sequence store ID, destination 및 role ARN와 같은 모든 파라미터를 입력sources으로 바꿉니다.

aws omics start-read-set-export-job 
--sequence-store-id sequence store id \
--destination valid s3 uri \
--role-arn role ARN \
--sources readSetId=read set id_1 readSetId=read set id_2                    

오리진 시퀀스 스토어 및 대상 Amazon S3 버킷에 대한 정보와 함께 다음 응답을 받습니다.

{
"id": <job-id>,
"sequenceStoreId": <sequence-store-id>,
"destination": <destination-s3-uri>,
"status": "SUBMITTED",
"creationTime": "2022-10-22T01:33:38.079000+00:00"
}                    

작업이 시작된 후 다음과 같이 get-read-set-export-job API 작업을 사용하여 상태를 확인할 수 있습니다. sequence store ID 및를 각각 시퀀스 스토어 ID 및 작업 IDjob ID로 바꿉니다.

aws omics get-read-set-export-job --id job-id --sequence-store-id sequence store ID

다음과 같이 list-read-set-export-jobs API 작업을 사용하여 시퀀스 스토어에 대해 초기화된 모든 내보내기 작업을 볼 수 있습니다. 를 시퀀스 스토어 IDsequence store ID로 바꿉니다.

aws omics list-read-set-export-jobs --sequence-store-id sequence store ID.

{
"exportJobs": [
  {
      "id": <job-id>,
      "sequenceStoreId": <sequence-store-id>,
      "destination": <destination-s3-uri>,
      "status": "COMPLETED",
      "creationTime": "2022-10-22T01:33:38.079000+00:00",
      "completionTime": "2022-10-22T01:34:28.941000+00:00"
  }
]
}        

읽기 세트를 내보내는 것 외에도 Amazon S3 액세스 URIs. 자세한 내용은 Amazon S3 URIs를 사용하여 HealthOmics 읽기 세트에 액세스를 참조하세요.