執行快取的內容

HealthOmics 會使用 S3 儲存貯體中的下列結構來組織您的執行快取：

s3://{cache.S3location}/{cache.uuid}/runID/taskID/{cacheentry.uuid}/

cache.uuid 是快取的全域唯一 ID。cacheentry.uuid 是快取任務的全域唯一 uuid。HealthOmics 會將 uuids 指派給快取和任務。

對於所有工作流程引擎，快取包含下列檔案：

• {cacheentryuuid}.json 檔案 – HealthOmics 會建立此資訊清單檔案，其中包含快取的相關資訊，包括快取中的所有項目清單，以及快取版本。

• 任務輸出檔案 – 每個任務輸出包含一或多個檔案，如任務所定義。

對於使用 Nextflow 的工作流程，Nextflow 引擎會在快取中建立這些額外的檔案：

• command.out 檔案 – 此檔案包含任務執行 stdout 內容。

• .exitcode 檔案 – 此檔案包含任務結束碼 （整數）。

注意

如果您想要存取執行快取中的中繼任務檔案以進行進階故障診斷，請在工作流程定義中將這些檔案宣告為任務輸出。