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Überprüfen Sie den Workflow-Status - AWS HealthOmics

Die vorliegende Übersetzung wurde maschinell erstellt. Im Falle eines Konflikts oder eines Widerspruchs zwischen dieser übersetzten Fassung und der englischen Fassung (einschließlich infolge von Verzögerungen bei der Übersetzung) ist die englische Fassung maßgeblich.

Überprüfen Sie den Workflow-Status

Nachdem Sie Ihren Workflow erstellt haben, können Sie den Status überprüfen und weitere Details des Workflows mithilfe von get-workflow anzeigen, wie in der Abbildung gezeigt.

aws omics get-workflow --id 1234567

Die Antwort enthält Workflow-Details, einschließlich des Status, wie gezeigt.

{
    "arn": "arn:aws:omics:us-west-2:....",
    "creationTime": "2022-07-06T00:27:05.542459" 
    "id": "1234567",
    "engine": "WDL",
    "status": "ACTIVE",
    "type": "PRIVATE",
    "main": "workflow-crambam.wdl",
    "name": "workflow_name",
    "storageType": "STATIC",
    "storageCapacity": "1200",
    "uuid": "64c9a39e-8302-cc45-0262-2ea7116d854f"   
  }

Sie können einen Lauf mit diesem Workflow starten, nachdem der Status zu geändert wurdeACTIVE.

Anmerkung

HealthOmics Führt bei Nextflow DSL2-Workflows den integrierten Strict-Linter während der Erstellung aus. Wenn der Linter Fehler oder Warnungen erkennt, wechselt der Workflow trotzdem zu ACTIVE, wobei das statusMessage Feld strukturierte Lint-Ergebnisse enthält. Wenn Sie einen Lauf für einen Workflow mit Linter-Fehlern starten, schlägt Ihr Lauf möglicherweise aufgrund einer falschen Workflow-Definition fehl. Ein Beispiel für die GetWorkflow Antwort mit Lint-Ergebnissen finden Sie unterDer Arbeitsablauf zeigt an HealthOmics.