Fichiers de définition du flux de travail dans HealthOmics - AWS HealthOmics

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Fichiers de définition du flux de travail dans HealthOmics

Vous utilisez une définition de flux de travail pour spécifier des informations sur le flux de travail, les exécutions et les tâches des exécutions. Vous créez des définitions de flux de travail dans un ou plusieurs fichiers à l'aide d'un langage de définition de flux de travail. HealthOmics prend en charge les définitions de flux de travail écrites en WDL, Nextflow ou CWL. Pour plus de détails sur chacune de ces langues, voir Rédaction de définitions pour les HealthOmics flux de travail

Vous spécifiez les types d'informations suivants dans la définition du flux de travail :

  • Language version— La langue et la version de la définition du flux de travail.

  • Compute and memory— Les besoins en calcul et en mémoire pour les tâches du flux de travail.

  • Inputs— Emplacement des entrées pour les tâches du flux de travail. Pour de plus amples informations, veuillez consulter HealthOmics exécuter les entrées.

  • Outputs— Emplacement pour enregistrer les résultats générés par les tâches.

  • Task resources— Besoins en calcul et en mémoire pour chaque tâche.

  • Accelerators— les autres ressources requises par les tâches, telles que les accélérateurs.

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