Membuat alur kerja pribadi di HealthOmics - AWS HealthOmics

Terjemahan disediakan oleh mesin penerjemah. Jika konten terjemahan yang diberikan bertentangan dengan versi bahasa Inggris aslinya, utamakan versi bahasa Inggris.

Membuat alur kerja pribadi di HealthOmics

Alur kerja pribadi bergantung pada berbagai sumber daya yang Anda buat dan konfigurasikan sebelum membuat alur kerja:

  • Workflow definition file: File definisi alur kerja yang ditulis dalamWDL,Nextflow, atauCWL. Definisi alur kerja menentukan input dan output untuk menjalankan yang menggunakan alur kerja. Ini juga mencakup spesifikasi untuk menjalankan dan menjalankan tugas untuk alur kerja Anda, termasuk persyaratan komputasi dan memori. File definisi alur kerja harus dalam .zip format. Untuk informasi selengkapnya, lihat File definisi alur kerja di HealthOmics.

  • Parameter template file(opsional): File template parameter yang ditulis dalamJSON. Buat file untuk menentukan parameter run, atau HealthOmics buat template parameter untuk Anda. Untuk informasi selengkapnya, lihat File templat parameter untuk HealthOmics alur kerja.

  • Amazon ECR container images: Buat gambar kontainer untuk alur kerja dan simpan di repositori Amazon ECR pribadi.

  • Sentieon licenses(opsional): Minta Sentieon lisensi untuk menggunakan Sentieon perangkat lunak dalam alur kerja pribadi.

Secara opsional, Anda dapat menjalankan linter pada definisi alur kerja sebelum atau setelah Anda membuat alur kerja. linterTopik ini menjelaskan linter yang tersedia di HealthOmics.