Membuat atau memperbarui alur kerja - AWS HealthOmics

Terjemahan disediakan oleh mesin penerjemah. Jika konten terjemahan yang diberikan bertentangan dengan versi bahasa Inggris aslinya, utamakan versi bahasa Inggris.

Membuat atau memperbarui alur kerja

Untuk membuat alur kerja pribadi, Anda perlu:

  • Workflow definition file: File definisi alur kerja yang ditulis dalamWDL,Nextflow, atauCWL. Definisi alur kerja menentukan input dan output untuk menjalankan yang menggunakan alur kerja. Ini juga mencakup spesifikasi untuk menjalankan dan menjalankan tugas untuk alur kerja Anda, termasuk persyaratan komputasi dan memori. File definisi alur kerja harus dalam .zip format. Untuk informasi selengkapnya, lihat File definisi alur kerja di HealthOmics.

  • Parameter template file(opsional): File template parameter yang ditulis dalamJSON. Buat file untuk menentukan parameter run, atau HealthOmics buat template parameter untuk Anda. Untuk informasi selengkapnya, lihat File templat parameter untuk HealthOmics alur kerja.

  • Amazon ECR container images: Buat gambar kontainer untuk alur kerja dan simpan di repositori Amazon ECR pribadi.

  • Sentieon licenses(opsional): Minta Sentieon lisensi untuk menggunakan Sentieon perangkat lunak dalam alur kerja pribadi.

Untuk file definisi alur kerja yang lebih besar dari 4 MiB (zip), pilih salah satu opsi ini selama pembuatan alur kerja:

  • Unggah ke folder Amazon Simple Storage Service dan tentukan lokasinya.

  • Unggah ke repositori eksternal (ukuran maksimal 1 GiB) dan tentukan detail repositori.

Setelah membuat alur kerja, Anda dapat memperbarui informasi alur kerja berikut dengan operasi: UpdateWorkflow

  • Nama

  • Penjelasan

  • Jenis penyimpanan default

  • Kapasitas penyimpanan default (dengan ID alur kerja)

  • Berkas README.md

Untuk mengubah informasi lain dalam alur kerja, buat alur kerja atau versi alur kerja baru.

Gunakan pembuatan versi alur kerja untuk mengatur dan menyusun alur kerja Anda. Versi juga membantu Anda mengelola pengenalan pembaruan alur kerja berulang. Untuk informasi selengkapnya tentang versi, lihatBuat versi alur kerja.

Topik