Verifica lo stato del flusso di lavoro

Dopo aver creato il flusso di lavoro, è possibile verificarne lo stato e visualizzarne altri dettagli utilizzando get-workflow, come illustrato.

aws omics get-workflow --id 1234567 

La risposta include i dettagli del flusso di lavoro, incluso lo stato, come mostrato.

{
    "arn": "arn:aws:omics:us-west-2:....",
    "creationTime": "2022-07-06T00:27:05.542459" 
    "id": "1234567",
    "engine": "WDL",
    "status": "ACTIVE",
    "type": "PRIVATE",
    "main": "workflow-crambam.wdl",
    "name": "workflow_name",
    "storageType": "STATIC",
    "storageCapacity": "1200",
    "uuid": "64c9a39e-8302-cc45-0262-2ea7116d854f"   
  }       

È possibile avviare un'esecuzione utilizzando questo flusso di lavoro dopo il passaggio allo ACTIVE stato.

Nota

Per i flussi di lavoro Nextflow DSL2, HealthOmics esegue il puntatore rigoroso integrato durante la creazione. Se il linter rileva errori o avvisi, il flusso di lavoro passa comunque ad ACTIVE, con il campo contenente risultati di lint strutturati. statusMessage Se si avvia un'esecuzione su un flusso di lavoro con errori di puntamento, l'esecuzione potrebbe non riuscire a causa di una definizione errata del flusso di lavoro. Per un esempio della GetWorkflow risposta con i risultati di lint, vedere. Il flusso di lavoro si interrompe HealthOmics