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HealthOmics のプライベートワークフロー
独自のワークフロー定義を作成する場合は、プライベートワークフローを使用します。ワークフロー定義は、ワークフローに関する情報を指定し、ワークフロータスクを定義します。実行はワークフローの単一の呼び出しであり、タスクは実行内の単一のプロセスです。
HealthOmics は、Workflow Description Language (WDL)、Common Workflow Language (CWL)、または Nextflow で作成するワークフロー定義をサポートしています。
HealthOmics ワークフローには、次のオプション機能があります。
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Run groups – プライベートワークフローを実行グループに追加して、コンピューティングの使用状況を制御できます。実行グループは、最大同時実行数や最大実行期間など、一連のリソース制限を共有するワークフロー実行のコレクションです。これらの制限を設定して、実行グループが消費するコンピューティングリソースを制御します。
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Call caching – 呼び出しキャッシュを使用してタスク出力を保存および再利用できるため、実行時間が短縮され、コンピューティングコストが削減されます。
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Sharing workflows – プライベートワークフローは、同じリージョン AWS アカウント 内の他の と共有できます。
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Workflow versions – プライベートワークフローのバージョンを作成できます。ワークフローのバージョニングにより、ユーザーは更新された機能の使用を開始するタイミングを選択できます。ワークフローバージョンはイミュータブルであり、ワークフローと同じレベルのデータ出所を提供します。
ワークフローの IAM アクセス許可の設定については、「」を参照してくださいHealthOmics の IAM アクセス許可。
HealthOmics プライベートワークフローの使用方法の完全な例については、HealthOmics Github チュートリアル
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