워크플로 생성 또는 업데이트 - AWS HealthOmics

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워크플로 생성 또는 업데이트

프라이빗 워크플로를 생성하려면 다음이 필요합니다.

  • Workflow definition file: WDL, Nextflow또는 로 작성된 워크플로 정의 파일입니다CWL. 워크플로 정의는 워크플로를 사용하는 실행의 입력과 출력을 지정합니다. 또한 컴퓨팅 및 메모리 요구 사항을 포함하여 워크플로의 실행 및 실행 작업에 대한 사양도 포함되어 있습니다. 워크플로 정의 파일은 .zip 형식이어야 합니다. 자세한 내용은 HealthOmics의 워크플로 정의 파일을 참조하세요. HealthOmics

  • Parameter template file (선택 사항):에 작성된 파라미터 템플릿 파일입니다JSON. 파일을 생성하여 실행 파라미터를 정의하거나 HealthOmics가 파라미터 템플릿을 생성합니다. 자세한 내용은 HealthOmics 워크플로용 파라미터 템플릿 파일을 참조하세요.

  • Amazon ECR container images: 워크플로에 대한 컨테이너 이미지를 생성하고 프라이빗 Amazon ECR 리포지토리에 저장합니다.

  • Sentieon licenses (선택 사항): 프라이빗 워크플로에서 Sentieon 소프트웨어를 사용할 수 있는 Sentieon 라이선스를 요청합니다.

4MiB(압축)보다 큰 워크플로 정의 파일의 경우 워크플로 생성 중에 다음 옵션 중 하나를 선택합니다.

  • Amazon Simple Storage Service 폴더에 업로드하고 위치를 지정합니다.

  • 외부 리포지토리(최대 크기 1GiB)에 업로드하고 리포지토리 세부 정보를 지정합니다.

워크플로를 생성한 후 UpdateWorkflow 작업으로 다음 워크플로 정보를 업데이트할 수 있습니다.

  • 명칭

  • 설명

  • 기본 스토리지 유형

  • 기본 스토리지 용량(워크플로 ID 사용)

  • README.md 파일

워크플로의 다른 정보를 변경하려면 새 워크플로 또는 워크플로 버전을 생성합니다.

워크플로 버전 관리를 사용하여 워크플로를 구성하고 구조화합니다. 버전은 반복 워크플로 업데이트의 도입을 관리하는 데도 도움이 됩니다. 버전에 대한 자세한 내용은 워크플로 버전 생성을 참조하십시오.