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HealthOmics análises
HealthOmics a análise suporta o armazenamento e a análise de variantes e anotações genômicas. O Analytics fornece dois tipos de recursos de armazenamento: lojas de variantes e lojas de anotações. Você usa esses recursos para armazenar, transformar e consultar dados de variantes genômicas e dados de anotação. Depois de importar dados para um armazenamento de dados, você pode usar o Athena para realizar análises avançadas nos dados.
Você pode usar o HealthOmics console ou a API para criar e gerenciar lojas, importar dados e compartilhar dados analíticos da loja com colaboradores.
A variante armazena dados de suporte em formatos VCF, e a anotação armazena suporte TSV/CSV e formatos. GFF3 As coordenadas genômicas são representadas como intervalos semiabertos semicerrados baseados em zero. Quando seus dados estão no armazenamento de dados HealthOmics analíticos, o acesso aos arquivos VCF é gerenciado por meio AWS Lake Formation de. Em seguida, você pode consultar os arquivos VCF usando o Amazon Athena. As consultas devem usar o mecanismo de consulta Athena versão 3. Para ler mais sobre as versões do mecanismo de consulta do Athena, consulte a documentação do Amazon Athena.
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