Arquivos de definição de fluxo de trabalho em HealthOmics - AWS HealthOmics

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Arquivos de definição de fluxo de trabalho em HealthOmics

Você usa uma definição de fluxo de trabalho para especificar informações sobre o fluxo de trabalho, as execuções e as tarefas nas execuções. Você cria definições de fluxo de trabalho em um ou mais arquivos usando uma linguagem de definição de fluxo de trabalho. HealthOmics suporta definições de fluxo de trabalho escritas em WDL, Nextflow ou CWL. Para obter detalhes sobre cada um desses idiomas, consulte Escrevendo definições de fluxo de trabalho para fluxos HealthOmics de trabalho

Você especifica os seguintes tipos de informações na definição do fluxo de trabalho:

  • Language version— O idioma e a versão da definição do fluxo de trabalho.

  • Compute and memory— Os requisitos de computação e memória para tarefas no fluxo de trabalho.

  • Inputs— Localização das entradas para as tarefas do fluxo de trabalho. Para obter mais informações, consulte HealthOmics entradas de execução.

  • Outputs— Localização para salvar as saídas que as tarefas geram.

  • Task resources— Requisitos de computação e memória para cada tarefa.

  • Accelerators— outros recursos que as tarefas exigem, como aceleradores.

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