HealthOmics 分析 - AWS HealthOmics

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HealthOmics 分析

HealthOmics analytics 支持基因组变异和注释的存储和分析。Analytics 提供两种类型的存储资源——变体存储和注释存储。您可以使用这些资源来存储、转换和查询基因组变异数据和注释数据。将数据导入数据存储后,可以使用 Athena 对数据进行高级分析。

您可以使用 HealthOmics 控制台或 API 来创建和管理商店、导入数据以及与合作者共享分析商店数据。

变体存储支持 VCF 格式的数据,注释存储支持 TSV/CSV 和 GFF3格式。基因组坐标表示为从零开始、半封闭的半开区间。当您的数据存储在 HealthOmics 分析数据存储中时,将通过 AWS Lake Formation管理对 VCF 文件的访问权限。然后,您可以使用亚马逊 Athena 查询 VCF 文件。查询必须使用 Athena 查询引擎版本 3。要了解有关 Athena 查询引擎版本的更多信息,请参阅亚马逊 A thena 文档。