HealthOmics 固定大小配額 - AWS HealthOmics

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HealthOmics 固定大小配額

除了 之外HealthOmics 服務配額,HealthOmics 還包含具有固定大小的配額。您無法請求增加這些值。

除非另有說明,否則每個配額都會列出每個區域的最大值。

HealthOmics 分析固定大小配額

下表顯示分析配額支援的值上限。這些值無法調整。

名稱 描述 最大 可調整 是/否
分析 - 每個註釋存放區匯入任務的檔案上限 每個註釋匯入任務的檔案數量上限。 1

HealthOmics 儲存體固定大小配額

下表顯示儲存檔案支援的值上限。這些值無法調整。

名稱 描述 最大 可調整 是/否
儲存 - S3 存取資源政策大小上限 S3 存取資源政策的大小上限 15 KB
儲存 - 傳播集層級標籤上限 每個存放區傳播到 S3 物件的設定層級標籤索引鍵數目上限 5
儲存 - 每個啟用任務的讀取集上限 每個啟用任務的讀取集數量上限。 20
儲存 - 每個匯出任務的讀取集上限 每個匯出任務的讀取集數目上限。 100
儲存 - 每個匯入任務的讀取集上限 每個匯入任務的讀取集數目上限。 100
儲存 - 最大參考儲存 參考存放區的數目上限。 1
儲存 - 直接上傳的部分大小上限 直接上傳至序列存放區的組件大小上限。 100 MB
儲存 - 檔案中用於直接上傳的部分上限 要直接上傳至序列存放區的檔案中的組件數量上限。 10,000
儲存 - 參考大小上限 可匯入至參考存放區的參考檔案大小上限。 15 GB
儲存 - 讀取集來源大小上限 讀取集中單一來源檔案的大小上限,可匯入序列存放區。 976 GB

HealthOmics 工作流程固定大小配額

下表顯示工作流程配額支援的值上限。這些值無法調整。

名稱 描述 大小上限 可調整 是/否
工作流程 - 執行群組上限 執行群組的數量上限。 1000
工作流程 - 執行快取上限 您可以為一個帳戶建立的執行快取數目上限。

一個或多個執行可以共用相同的執行快取。HealthOmics 可以為每個帳戶快取的執行次數沒有配額。

1000
工作流程 - 工作流程版本上限 每個工作流程的工作流程版本數目上限。 1000
工作流程 - CPU 執行個體容器大小 CPU 執行個體的容器映像大小上限。 45 GiB
工作流程 - GPU 執行個體容器大小 GPU 執行個體的容器映像大小上限。 95 GiB
GPU 執行個體 /dev/shm 共用記憶體 每個 GPU 執行個體的共用記憶體數量上限。 每個 GPU 8 GB
工作流程 - 執行參數檔案 執行參數檔案的大小上限。 50,000 個位元組
工作流程 - 工作流程參數範本檔案 工作流程參數範本檔案的項目數量上限和檔案大小上限。此配額適用於您使用主控台或 API 建立的工作流程。 1,000 個項目,400 KB
工作流程 - 工作流程定義檔案大小 - API 當您使用 API 操作或 AWS SDK 建立工作流程時,工作流程定義檔案的大小上限。 100 MB
工作流程 - 工作流程定義檔案大小 - 主控台 (直接上傳) 當您使用主控台建立工作流程時,您可以直接上傳的工作流程定義檔案大小上限。 4.4 MB
工作流程 - 工作流程定義檔案大小 - 主控台 (從 Amazon S3 上傳) 當您使用主控台建立工作流程時,可以從 Amazon S3 上傳提供的工作流程定義檔案大小上限。 100 MB
工作流程 - 儲存庫大小 外部程式碼儲存庫的大小上限。 1 GiB
工作流程 - 儲存庫個別檔案大小 來自外部程式碼儲存庫的個別檔案大小上限。 100 MiB
工作流程 - README 檔案大小 README 檔案的大小上限。 500 KiB

如需如何減少執行參數檔案大小的建議,請參閱 管理執行參數大小

HealthOmics Ready2Run 工作流程固定大小配額

每個 Ready2Run 工作流程都有最大輸入檔案大小。在下表中,檔案大小單位會以 Gibibytes (GiB) 列出。這些檔案大小上限無法調整。

Ready2Run 工作流程名稱 輸入檔案大小上限 (GiB) 可調整 (是/否)
AlphaFold 用於 601-1200 殘差 1
AlphaFold 最多可用於 600 個殘差 1
Bases2Fastq for 2x150 1000
Bases2Fastq for 2x300 1000
Bases2Fastq for 2x75 500
ESMFold 最多可用於 800 個殘差 1
GATK-BP fq2bam 64
適用於 30 倍基因體的 GATK-BP Germline bam2vcf 39
適用於 30 倍基因體的 GATK-BP Germline fq2vcf 64
GATK-BP 體力 WES bam2vcf 86
NVIDIA Parabricks BAM2FQ2BAM WGS,最多可達 30X 80
NVIDIA Parabricks BAM2FQ2BAM WGS,最多可達 50X 120
NVIDIA Parabricks BAM2FQ2BAM WGS 最多可達 5X 20
NVIDIA Parabricks FQ2BAM WGS 最多可達 30X 71
高達 50X的 NVIDIA Parabricks FQ2BAM WGS 137
NVIDIA Parabricks FQ2BAM WGS 最多可達 5X 13
高達 30X的 NVIDIA Parabricks Germline DeepVariant WGS 71
高達 50X的 NVIDIA Parabricks Germline DeepVariant WGS 137
NVIDIA Parabricks Germline DeepVariant WGS 最多可達 5X 12
NVIDIA Parabricks Germline HaplotypeCaller WGS 最多可達 30X 71
NVIDIA Parabricks Germline HaplotypeCaller WGS 最多可達 50X 137
NVIDIA Parabricks Germline HaplotypeCaller WGS 最多可達 5X 13
NVIDIA Parabricks 體力 Mutect2 WGS,最多可達 50X 196
scRNAseq 與 KallistoBUStools 119
scRNAseq 搭配 Salmon Alevin-fry 119
scRNAseq 搭配 STARsolo 119
Sentieon Germline BAM WES 高達 300 倍 9
Sentieon Germline BAM WGS 最多可達 32 倍 18
Sentieon Germline FASTQ WES 高達 100 倍 5
Sentieon Germline FASTQ WES 高達 300 倍 26
Sentieon Germline FASTQ WGS 最多可達 32 倍 51
適用於 ONT 的 Sentieon LongRead 25
適用於 PacBio HiFi 的 Sentieon LongRead 58
Sentieon 體操 WES 50
Sentieon 體操 WGS 113
Ultima Genomics DeepVariant 最多可達 40 倍 91