HealthOmics 分析 - AWS HealthOmics

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HealthOmics 分析

HealthOmics 分析支援儲存和分析基因體變體和註釋。Analytics 提供兩種類型的儲存資源:變體存放區和註釋存放區。您可以使用這些資源來存放、轉換和查詢基因體變體資料和註釋資料。將資料匯入資料存放區後,您可以使用 Athena 對資料進行進階分析。

您可以使用 HealthOmics 主控台或 API 來建立和管理存放區、匯入資料,以及與協作者共用分析存放區資料。

變體會以 VCF 格式存放支援資料,而註釋存放區支援 TSV/CSV 和 GFF3 格式。基因體座標表示為以零為基礎的半封閉半開間隔。當您的資料位於 HealthOmics 分析資料存放區時,將透過 管理對 VCF 檔案的存取 AWS Lake Formation。然後,您可以使用 Amazon Athena 查詢 VCF 檔案。查詢必須使用 Athena 查詢引擎版本 3。若要進一步了解 Athena 查詢引擎版本,請參閱 Amazon Athena 文件