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Workflow-Definitionsdateien in HealthOmics
Sie verwenden eine Workflow-Definition, um Informationen über den Workflow, die Läufe und die Aufgaben in den Läufen anzugeben. Sie erstellen Workflow-Definitionen in einer oder mehreren Dateien mithilfe einer Workflow-Definitionssprache. HealthOmics unterstützt in WDL, Nextflow oder CWL geschriebene Workflow-Definitionen. Einzelheiten zu jeder dieser Sprachen finden Sie unter Workflow-Definitionen für HealthOmics Workflows schreiben
In der Workflow-Definition geben Sie die folgenden Arten von Informationen an:
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Language version— Die Sprache und Version der Workflow-Definition.
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Compute and memory— Die Rechen- und Speicheranforderungen für Aufgaben im Workflow.
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Inputs— Speicherort der Eingaben für die Workflow-Aufgaben. Weitere Informationen finden Sie unter HealthOmics Eingaben ausführen.
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Outputs— Speicherort für die von den Aufgaben generierten Ausgaben.
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Task resources— Rechen- und Speicheranforderungen für jede Aufgabe.
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Accelerators— andere Ressourcen, die für die Aufgaben erforderlich sind, z. B. Beschleuniger.