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HealthOmics analítica
HealthOmics La analítica permite almacenar y analizar variantes y anotaciones genómicas. Analytics proporciona dos tipos de recursos de almacenamiento: almacenes de variantes y almacenes de anotaciones. Estos recursos se utilizan para almacenar, transformar y consultar datos de variantes genómicas y datos de anotaciones. Tras importar los datos a un almacén de datos, puede utilizar Athena para realizar análisis avanzados de los datos.
Puede usar la HealthOmics consola o la API para crear y administrar almacenes, importar datos y compartir datos analíticos del almacén con sus colaboradores.
Los almacenes de variantes admiten datos en formatos VCF, y los almacenes de anotaciones admiten TSV/CSV y dan formato. GFF3 Las coordenadas genómicas se representan como intervalos de base cero, semicerrados y semiabiertos. Cuando sus datos están en el almacén de datos de HealthOmics análisis, el acceso a los archivos VCF se gestiona a través de él. AWS Lake Formation A continuación, puede consultar los archivos VCF mediante Amazon Athena. Las consultas deben utilizar la versión 3 del motor de consultas Athena. Para obtener más información sobre las versiones del motor de consultas de Athena, consulte la documentación de Amazon Athena.