Archivos de definición de flujos de trabajo en HealthOmics

Utilice una definición de flujo de trabajo para especificar información sobre el flujo de trabajo, las ejecuciones y las tareas de las ejecuciones. Las definiciones de flujo de trabajo se crean en uno o más archivos mediante un lenguaje de definición de flujos de trabajo. HealthOmics admite definiciones de flujo de trabajo escritas en WDL, Nextflow o CWL. Para obtener más información sobre cada uno de estos idiomas, consulte Escribir definiciones de flujos de trabajo para HealthOmics flujos de trabajo

Los siguientes tipos de información se especifican en la definición del flujo de trabajo:

• Language version— El idioma y la versión de la definición del flujo de trabajo.

• Compute and memory— Los requisitos de cómputo y memoria para las tareas del flujo de trabajo.

• Inputs— Ubicación de las entradas a las tareas del flujo de trabajo. Para obtener más información, consulte HealthOmics ejecutar entradas.

• Outputs— Ubicación para guardar las salidas que generan las tareas.

• Task resources— Requisitos de cómputo y memoria para cada tarea.

• Accelerators— otros recursos que requieran las tareas, como los aceleradores.

Temas

• HealthOmics requisitos de definición del flujo de trabajo

• Soporte de versiones para lenguajes de definición HealthOmics de flujos de trabajo

• Requisitos de cómputo y memoria para HealthOmics las tareas

• Resultados de tareas en una definición de HealthOmics flujo de trabajo

• Recursos de tareas en una definición de HealthOmics flujo de trabajo

• Aceleradores de tareas en una definición de flujo de trabajo HealthOmics

• Escribir definiciones de flujos de trabajo para HealthOmics flujos de trabajo