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Crear flujos de trabajo privados en HealthOmics
Los flujos de trabajo privados dependen de una variedad de recursos que se crean y configuran antes de crear el flujo de trabajo:
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Workflow definition file: un archivo de definición de flujo de trabajo escrito en WDLNextflow, oCWL. La definición del flujo de trabajo especifica las entradas y salidas de las ejecuciones que utilizan el flujo de trabajo. También incluye especificaciones para las ejecuciones y tareas de ejecución del flujo de trabajo, incluidos los requisitos de procesamiento y memoria. El archivo de definición del flujo de trabajo debe estar en
.zipformato. Para obtener más información, consulte Archivos de definición de flujo de trabajo en HealthOmics. -
Parameter template file(opcional): un archivo de plantilla de parámetros escrito en élJSON. Cree el archivo para definir los parámetros de ejecución o HealthOmics genere automáticamente la plantilla de parámetros. Para obtener más información, consulte Archivos de plantillas de parámetros para HealthOmics flujos de trabajo.
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Amazon ECR container images: cree imágenes de contenedor para el flujo de trabajo y guárdelas en un repositorio privado de Amazon ECR.
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Sentieon licenses(opcional): solicite una Sentieon licencia para usar el Sentieon software en flujos de trabajo privados.
Si lo desea, puede ejecutar un resumen de la definición del flujo de trabajo antes o después de crearlo. En linter este tema se describen las linters disponibles en. HealthOmics
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