Workflows privés dans HealthOmics - AWS HealthOmics

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Workflows privés dans HealthOmics

Utilisez des flux de travail privés lorsque vous souhaitez créer votre propre définition de flux de travail. La définition du flux de travail fournit des informations sur le flux de travail et définit les tâches du flux de travail. Une exécution est une invocation unique d'un flux de travail, et une tâche est un processus unique au sein de l'exécution.

HealthOmics prend en charge les définitions de flux de travail que vous créez dans le langage WDL (Workflow Description Language), le langage CWL (Common Workflow Language) ou Nextflow.

HealthOmics les flux de travail fournissent les fonctionnalités optionnelles suivantes :

  • Run groups— Vous pouvez ajouter des flux de travail privés à un groupe d'exécution pour contrôler l'utilisation du calcul. Un groupe d'exécution est un ensemble d'exécutions de flux de travail partageant un ensemble de limites de ressources, telles que le nombre maximum d'exécutions simultanées et la durée d'exécution maximale. Vous définissez ces limites pour contrôler les ressources de calcul consommées par le groupe d'exécution.

  • Call caching— Vous pouvez utiliser un cache d'appels pour enregistrer et réutiliser les résultats des tâches, ce qui permet de réduire les durées d'exécution et de réduire les coûts de calcul.

  • Sharing workflows— Vous pouvez partager vos flux de travail privés avec d'autres Comptes AWS personnes de la même région.

  • Workflow versions— Vous pouvez créer des versions d'un flux de travail privé. La gestion des versions des flux de travail permet aux utilisateurs de choisir à quel moment ils souhaitent commencer à utiliser les fonctionnalités mises à jour. Les versions de flux de travail sont immuables et fournissent le même niveau de provenance des données que les flux de travail.

Pour plus d'informations sur la configuration des autorisations IAM pour les flux de travail, consultezAutorisations IAM pour HealthOmics.

Pour des exemples complets d'utilisation de flux de travail HealthOmics privés, consultez les didacticiels HealthOmics Github ou le didacticiel de bout en bout de l'atelier AWS pour HealthOmics.