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HealthOmics analisi
HealthOmics l'analisi supporta l'archiviazione e l'analisi di varianti e annotazioni genomiche. Analytics fornisce due tipi di risorse di archiviazione: gli archivi di varianti e gli archivi di annotazioni. Queste risorse vengono utilizzate per archiviare, trasformare e interrogare i dati delle varianti genomiche e i dati di annotazione. Dopo aver importato i dati in un datastore, puoi utilizzare Athena per eseguire analisi avanzate sui dati.
Puoi utilizzare la HealthOmics console o l'API per creare e gestire archivi, importare dati e condividere i dati degli archivi analitici con i collaboratori.
Gli archivi Variant supportano i dati nei formati VCF e gli archivi di annotazione supportano il supporto e i formati. TSV/CSV GFF3 Le coordinate genomiche sono rappresentate come intervalli a base zero, semichiusi e semiaperti. Quando i dati si trovano nell'archivio dati di HealthOmics analisi, l'accesso ai file VCF viene gestito tramite. AWS Lake Formation Puoi quindi interrogare i file VCF utilizzando Amazon Athena. Le interrogazioni devono utilizzare il motore di interrogazione Athena versione 3. Per ulteriori informazioni sulle versioni del motore di query Athena, consulta la documentazione di Amazon Athena.
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