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HealthOmics 分析
HealthOmics 分析は、ゲノムバリアントと注釈の保存と分析をサポートします。Analytics には、バリアントストアと注釈ストアの 2 種類のストレージリソースが用意されています。これらのリソースを使用して、ゲノムバリアントデータと注釈データを保存、変換、クエリします。データストアにデータをインポートした後、Athena を使用してデータに対して高度な分析を実行できます。
HealthOmics コンソールまたは API を使用して、ストアの作成と管理、データのインポート、共同作業者との分析ストアデータの共有を行うことができます。
バリアントストアは VCF 形式のデータをサポートし、注釈ストアは TSV/CSV および GFF3 形式をサポートします。ゲノム座標は、ゼロベースの半分閉じた半開き間隔として表されます。データが HealthOmics 分析データストアにある場合、VPC ファイルへのアクセスは によって管理されます AWS Lake Formation。その後、Amazon Athena を使用して VCF ファイルをクエリできます。クエリは Athena クエリエンジンバージョン 3 を使用する必要があります。Athena クエリエンジンのバージョンの詳細については、Amazon Athena ドキュメントを参照してください。
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