HealthOmics에서 프라이빗 워크플로 생성 - AWS HealthOmics

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HealthOmics에서 프라이빗 워크플로 생성

프라이빗 워크플로는 워크플로를 생성하기 전에 생성하고 구성하는 다양한 리소스에 따라 달라집니다.

  • Workflow definition file: WDL, Nextflow또는 로 작성된 워크플로 정의 파일입니다CWL. 워크플로 정의는 워크플로를 사용하는 실행의 입력과 출력을 지정합니다. 또한 컴퓨팅 및 메모리 요구 사항을 포함하여 워크플로의 실행 및 실행 작업에 대한 사양도 포함되어 있습니다. 워크플로 정의 파일은 .zip 형식이어야 합니다. 자세한 내용은 HealthOmics의 워크플로 정의 파일을 참조하세요. HealthOmics

  • Parameter template file (선택 사항):에 작성된 파라미터 템플릿 파일입니다JSON. 파일을 생성하여 실행 파라미터를 정의하거나 HealthOmics가 파라미터 템플릿을 생성합니다. 자세한 내용은 HealthOmics 워크플로용 파라미터 템플릿 파일을 참조하세요.

  • Amazon ECR container images: 워크플로에 대한 컨테이너 이미지를 생성하고 프라이빗 Amazon ECR 리포지토리에 저장합니다.

  • Sentieon licenses (선택 사항): 프라이빗 워크플로에서 Sentieon 소프트웨어를 사용할 수 있는 Sentieon 라이선스를 요청합니다.

선택적으로 워크플로를 생성하기 전이나 후에 워크플로 정의에서 린터를 실행할 수 있습니다. 이 linter 주제에서는 HealthOmics에서 사용할 수 있는 린터에 대해 설명합니다.