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HealthOmics Analytik
HealthOmics analytics unterstützt die Speicherung und Analyse genomischer Varianten und Annotationen. Analytics bietet zwei Arten von Speicherressourcen: Variantenspeicher und Annotationsspeicher. Sie verwenden diese Ressourcen, um genomische Variantendaten und Annotationsdaten zu speichern, zu transformieren und abzufragen. Nachdem Sie Daten in einen Datenspeicher importiert haben, können Sie mit Athena erweiterte Analysen der Daten durchführen.
Sie können die HealthOmics Konsole oder API verwenden, um Geschäfte zu erstellen und zu verwalten, Daten zu importieren und analytische Speicherdaten mit Mitarbeitern zu teilen.
Variant speichert Unterstützungsdaten in VCF-Formaten, und Annotation speichert Unterstützung TSV/CSV und Formate. GFF3 Genomische Koordinaten werden als auf Null basierende, halbgeschlossene, halboffene Intervalle dargestellt. Wenn sich Ihre Daten im HealthOmics Analysedatenspeicher befinden, wird der Zugriff auf die VCF-Dateien über verwaltet. AWS Lake Formation Anschließend können Sie die VCF-Dateien mithilfe von Amazon Athena abfragen. Abfragen müssen die Athena Query Engine Version 3 verwenden. Weitere Informationen zu den Versionen der Athena-Abfrage-Engine finden Sie in der Amazon Athena Athena-Dokumentation.
